Новое программное обеспечение на основе искусственного интеллекта позволяет быстро и надежно визуализировать белки в клетках

Электронная криотомография (крио-ЭТ) становится мощной техникой для получения подробных трехмерных изображений клеточной среды и замкнутых биомолекул. Однако одной из задач методологии является идентификация белковых молекул на изображениях для дальнейшей обработки. Исследовательская группа под руководством Стефана Раунсера, директора MPI молекулярной физиологии в Дортмунде, под руководством Торстена Вагнера, разработала программное обеспечение для выделения белков в переполненных клеточных объемах. Новый инструмент с открытым исходным кодом под названием TomoTwin основан на глубоком метрическом обучении и позволяет ученым находить несколько белков с высокой точностью и пропускной способностью без ручного создания или переобучения сети каждый раз. Статья опубликована в журнале Nature Methods. «TomoTwin прокладывает путь к автоматизированной идентификации и локализации белков непосредственно в их клеточном окружении, расширяя потенциал крио-ЭТ», — говорит Гэвин Райс, соавтор публикации. Cryo-ET может расшифровать, как биомолекулы работают внутри клетки, и тем самым раскрыть основы жизни и происхождение болезней. В эксперименте по крио-ЭТ ученые используют просвечивающую электронную микроскопию для получения трехмерных изображений, называемых томограммами, клеточного объема, содержащего сложные биомолекулы. Чтобы получить более детальное изображение каждого отдельного белка , они усредняют как можно больше их копий — подобно фотографам, делающим одну и ту же фотографию с разной экспозицией, чтобы позже объединить их в изображение с идеальной экспозицией. Важно правильно идентифицировать и расположить различные белки на картинке, прежде чем усреднять их. «Ученые могут делать сотни томограмм в день, но нам не хватало инструментов для полной идентификации молекул внутри них», — говорит Райс. До сих пор исследователи использовали алгоритмы, основанные на шаблонах уже известных молекулярных структур, для поиска совпадений на томограммах, но они, как правило, подвержены ошибкам. Идентификация молекул вручную — это еще один вариант, который обеспечивает высококачественный отбор, но занимает от нескольких дней до нескольких недель для каждого набора данных. Другой возможностью было бы использование формы контролируемого машинного обучения . Эти инструменты могут быть очень точными, но в настоящее время им не хватает удобства использования, поскольку они требуют ручной маркировки тысяч примеров для обучения программного обеспечения каждому новому белку, что является почти невыполнимой задачей для небольших биологических молекул в переполненной клеточной среде . ТомоТвин Недавно разработанное программное обеспечение TomoTwin преодолевает многие из этих препятствий: оно учится выбирать молекулы , похожие по форме, на томограмме и сопоставляет их с геометрическим пространством — система вознаграждается за размещение похожих белков рядом друг с другом и наказывается в противном случае. На новой карте исследователи могут изолировать и точно идентифицировать различные белки и использовать их для определения их местонахождения внутри клетки. «Одним из преимуществ TomoTwin является то, что мы предоставляем предварительно обученную модель комплектования», — говорит Райс. Убрав этап обучения, программа может работать даже на локальных компьютерах — там, где обработка томограммы обычно занимает 60–90 минут, время работы на суперкомпьютере MPI Raven сокращается до 15 минут на томограмму. TomoTwin позволяет исследователям выбирать десятки томограмм за то время, которое требуется для ручного выбора одной, тем самым увеличивая пропускную способность данных и скорость усреднения для получения более качественного изображения. В настоящее время программное обеспечение может обнаруживать глобулярные белки или белковые комплексы размером более 150 килодальтон в клетках; в будущем группа Раунсера стремится включить мембранные белки , нитевидные белки и белки меньших размеров....

Новое программное обеспечение на основе искусственного интеллекта позволяет быстро и надежно визуализировать белки в клетках

Сообщает android-robot.com

 

Новость из рубрики:

 

Поделиться новостью: Поделиться новостью в Facebook Поделиться новостью в Twittere Поделиться новостью в VK Поделиться новостью в Pinterest Поделиться новостью в Reddit

 
 

DeepMind разрабатывает SAFE, приложение на основе искусственного интеллекта, которое может проверять факты 11:00, 05 Апр DeepMind разрабатывает SAFE, приложение на основе искусственного интеллекта, которое может проверять факты Команда специалистов по искусственному интеллекту из Google DeepMind разработала систему на основе искусственного интеллекта под названием SAFE, которую можно использовать для проверки фактов результатов LLM, таких как ChatGPT. Группа опубликовала д...

Статистика CRM на основе данных позволяет более точно прогнозировать продажи 17:39, 24 Июн Статистика CRM на основе данных позволяет более точно прогнозировать продажи Управление взаимоотношениями с клиентами (CRM) – это мощный инструмент, помогающий компаниям управлять взаимодействием с клиентами и улучшать процессы продаж. Когда дело доходит до отдела продаж, CRM предлагает множество преимуществ и играет решающу...

Ученые получили новое волокно на основе паутины и шелка 22:00, 24 Сен Ученые получили новое волокно на основе паутины и шелка Китайские ученые генетически модифицировали тутовых шелкопрядов, чтобы получить материал, который в шесть раз прочнее кевлара. Последний используется в бронежилетах, пишет IFLScience. "Нити, которые создают шелковичные черви, то есть гусеницы шелкоп...

Новое компьютерное оборудование нуждается в теоретической основе, говорится в исследовании 10:00, 21 Окт Новое компьютерное оборудование нуждается в теоретической основе, говорится в исследовании Во всем мире ведется интенсивный поиск новых материалов для создания компьютерных микрочипов, основанных не на классических транзисторах, а на гораздо более энергосберегающих компонентах, подобных мозгу. Однако, несмотря на то, что теоретическая осн...

Замедление искусственного интеллекта не поможет, считает профессор 22:00, 07 Апр Замедление искусственного интеллекта не поможет, считает профессор Развитие искусственного интеллекта (ИИ) выходит из-под контроля, по мнению примерно 3000 человек, подписавших открытое письмо, опубликованное лидерами бизнеса и учеными. Подписанты призывают к временному прекращению обучения особо высокопроизводител...

The Beatles написали песню с помощью искусственного интеллекта 13:00, 23 Июн The Beatles написали песню с помощью искусственного интеллекта Один из основателей The Beatles Пол Маккартни рассказал, что искусственный интеллект дописал последнюю песню группы The Beatles. Об этом сообщает The Guardian. Музыкант рассказал, что использовал новую технологию, чтобы "вытащить" голос покойного Дж...

Meta представила новую модель искусственного интеллекта 04:00, 15 Май Meta представила новую модель искусственного интеллекта Компания Meta Platforms представила новую модель искусственного интеллекта с открытым кодом под названием ImageBind, сообщает издание Verge. Новая модель ИИ связывает несколько форм данных, таких как аудио, текст, визуальные данные, данные о глубине...

Открыт алгоритм для увеличения скорости обучения искусственного интеллекта 15:00, 08 Авг Открыт алгоритм для увеличения скорости обучения искусственного интеллекта Ученые из Tinkoff Research открыли алгоритм для увеличения скорости обучения искусственного интеллекта в 20 раз. Ученые из лаборатории исследований искусственного интеллекта (ИИ) Tinkoff Research открыли новый алгоритм для обучения ИИ. Новый метод, ...

08:00, 05 Сен Google привлекает компании к использованию облачного искусственного интеллекта Google заявила, что все глубже внедряет искусственный интеллект (ИИ) в свои облачные предложения, поскольку соперничает за бизнес фирм, стремящихся извлечь выгоду из этой технологии. Интернет-гигант представил новые функции на базе искусственного ин...

15:00, 02 Мар Представлена система искусственного интеллекта, предлагающая эмоциональную поддержку через чат Быстрое развитие моделей обработки естественного языка (NLP) и больших языковых моделей (LLM) позволило разработать новые диалоговые агенты для конкретного использования, предназначенные для ответа на определенные типы запросов. Они варьируются от а...

21:00, 21 Сен Как кибермошенники пытаются заставить инструменты искусственного интеллекта приносить прибыль Сторонники искусственного интеллекта говорят, что его потенциал безграничен. Но кибермошенники также могут использовать это в своих целях. Аналитики объяснили, как эта технология может повысить риск онлайн-преступлений. Фишеры электронных писем Чат-...

08:00, 22 Ноя Система искусственного интеллекта самоорганизуется для развития особенностей мозга сложных организмов Ученые из Кембриджа показали, что наложение физических ограничений на искусственно интеллектуальную систему – почти так же, как человеческий мозг должен развиваться и действовать в рамках физических и биологических ограничений – позволяет ему развив...

12:00, 17 Апр Представлен Taichi: крупномасштабный дифракционный гибридный фотонный чипсет искусственного интеллекта Объединенная команда инженеров из Университета Цинхуа и Пекинского национального исследовательского центра информационных наук и технологий, расположенных в Китае, разработала крупномасштабный дифракционный гибридный фотонный чипсет искусственного и...

04:00, 25 Июл В Москве при помощи искусственного интеллекта с начала года проанализированы 100 тысяч маммограмм С 2023 года Москва впервые в стране ввела специальный тариф в рамках обязательного медицинского страхования на анализ рентгеновских снимков с помощью сервисов искусственного интеллекта. Первым в ОМС включили анализ маммографических исследований. За ...

11:00, 19 Окт Модели искусственного интеллекта определяют биоразнообразие по звукам животных в тропических лесах Тропические леса являются одними из важнейших мест обитания на нашей планете. Они характеризуются чрезвычайно высоким видовым разнообразием и играют выдающуюся роль в глобальном углеродном цикле и мировом климате. Однако многие районы тропических ле...

07:00, 09 Окт Подход искусственного интеллекта позволил создать «спортивно умную» роботизированную собаку Когда-нибудь, когда случаются землетрясения, пожары и наводнения, первыми, кто отреагирует, станут стаи собак-роботов-спасателей, спешащих на помощь застрявшим душам. Эти четвероногие животные, работающие на батарейках, будут использовать компьютерн...

12:00, 15 Фев Мультимодальная модель искусственного интеллекта может помочь в персонализированном лечении туберкулеза Команда исследователей Мичиганского университета разработала мультимодальную модель искусственного интеллекта для прогнозирования результатов лечения больных туберкулезом (ТБ). Их анализ данных о пациентах по всему миру может привести к персонализац...

21:00, 18 Ноя Система искусственного интеллекта «Student of Games» компании Deep Mind может побеждать людей в различных играх Команда исследователей искусственного интеллекта из EquiLibre Technologies, Sony AI, Amii и Midjourney, работающая с проектом Google DeepMind, разработала систему искусственного интеллекта под названием Student of Games (SoG), которая способна как п...

13:00, 07 Окт Разрабатывают решения искусственного интеллекта для включения арабского языка и его диалектов в обработку естественного языка Группа исследователей и инженеров из Университета Шарджи разработала систему глубокого обучения для использования арабского языка и его разновидностей в приложениях, связанных с обработкой естественного языка (НЛП), междисциплинарной областью лингви...

02:00, 06 Мар Настоящему ИИ понадобится биология: компьютеры, работающие на клетках человеческого мозга Пришло время создать компьютер нового типа, говорят исследователи из Университета Джона Хопкинса вместе с доктором Бреттом Каганом, главным научным сотрудником Cortical Labs в Мельбурне, который недавно руководил разработкой проекта DishBrain, в кот...

03:00, 20 Авг Применение Газоанализа в Экологически Ориентированных Проектах: Обеспечение Экологической Безопасности в Металлургии и Добыче Современное развитие индустрии неотделимо от вопросов экологической безопасности и устойчивого развития. В условиях активного экономического роста Казахстана, страна акцентирует внимание на соблюдение норм экологической безопасности в различных отра...

08:19, 20 Июн Как и где быстро скачать лучшие торрент-игры 1. Найдите надежный торрент-сайт Прежде всего, вам нужно найти надежный торрент-сайт, предлагающий широкий выбор торрент-игр. Некоторые популярные варианты включают в себя The Pirate Bay, 1337x и RARBG. Будьте осторожны и используйте проверенные са...

20:08, 21 Ноя Написание дипломной работы. Быстро, дешево, профессионально Вы умны, независимы, работаете уже несколько лет и у вас нет времени на написание дипломной работы? Мы поможем вам создать и написать уникальную и актуальную дипломную работу. Вы получите дипломную работу, написанную специально для вас, по низкой це...

19:00, 20 Фев 3 правильных способа быстро сделать штробу в стене Современный ремонт подразумевает скрытие в стенах, полу и потолке практически всех коммуникаций — электропроводки, труб отопления и даже канализационных труб. Для каждого типа коммуникации приходится избирать особенный способ, соответствующий правил...

04:00, 11 Фев Стартап Thea Energy разработал подход к термоядерной энергии, объединяющий точность и экономичность — программное управление магнитами для стабилизации плазмы в термоядерных реакторах Стартап Thea Energy нацелился на создание инновационной термоядерной электростанции, применяя подход, который объединяет аспекты двух основных методов удержания плазмы: инерционного и магнитного. Основной задачей инженеров является достижение надежн...

01:00, 01 Ноя В чем секрет доски уиджи, которая позволяет «вызывать духов» Доска уиджи кажется крайне мистической штуковиной, но ее работу можно объяснить с точки зрения науки В фильмах ужасов вы могли видеть, как люди общаются с духами умерших людей при помощи доски с буквами алфавита и цифрами. Это приспособление принято...

09:00, 05 Апр Полупрозрачная камера позволяет отслеживать взгляд, не закрывая обзор Команда инженеров ICFO – Institut de Ciències Fotoniques Барселонского института науки и технологий разработала почти прозрачную камеру, которую можно использовать для отслеживания глаз, не закрывая обзора. Команда опубликовала документ , описывающи...

11:00, 12 Ноя Новая система виртуальной реальности позволяет вам делиться достопримечательностями на ходу Исследователи из Токийского столичного университета разработали систему удаленного сотрудничества в виртуальной реальности (VR), которая позволяет пользователям Segways делиться не только тем, что они видят, но и ощущением ускорения при движении. Во...

21:00, 28 Фев Шлем дополненной реальности позволяет пользователям видеть скрытые объекты Исследователи Массачусетского технологического института создали гарнитуру дополненной реальности, которая дает владельцу рентгеновское зрение. Гарнитура сочетает в себе компьютерное зрение и беспроводное восприятие, чтобы автоматически находить кон...

22:00, 13 Июл Машинное обучение позволяет выполнять точные расчеты электронной структуры в больших масштабах Машинное обучение позволяет выполнять точные расчеты электронной структуры в больших масштабах для моделирования материалов. Расположение электронов в веществе, известное как электронная структура, играет решающую роль в фундаментальных, но также и ...

00:00, 10 Ноя Новое сияние золота Влияние на рынок:3Интерес инвесторов к драгоценным металлам сияет с новой силой, так как часть инвесторов видит в них тихую гавань на фоне шторма крипторынка. Прорвавшись выше $1700 золото демонстрирует первые признаки слома нисходящего тренда, кото...

17:00, 04 Мар Новое покрытие обеспечит свежесть продуктам Как сказал хорошо известный персонаж «Мастера и Маргатиры», свежесть у продуктов может быть только одна. В мировом масштабе человечество ежедневно несет колоссальные убытки от того, что масса продуктов портится и просто выбрасывается на мусорку как ...

11:00, 09 Июн Компания Bandai представила новое поколение Tamagochi Компания Bandai выпустила новую модель легендарной игрушки Tamagochi. Это более технологичное устройство, чем предыдущие поколения. Об этом сообщается на сайте компании. В частности, игрушка позволяет фанатам объединяться совершенно новым способом –...

00:00, 06 Дек Twitter протестирует новое приложение с похожим названием Всех возможностей нового приложения пока не раскрывают, тем не менее, если режим тестирования пройдет удачно, программа станет доступна для пользователей в ближайшее время. Специалисты компании Twitter занимаются разработкой нового приложения с похо...

23:00, 03 Май HUAWEI выпустит новое приложение для рисования GoPaint С его помощью можно будет создавать произведения искусства на планшете. Дата выхода появилась на официальном аккаунте компании — GoPaint представят 7 мая. Для российских пользователей программа станет доступна в июле этого года. В приложении будет м...

02:00, 25 Окт Индекс цен на новое жилье в Канаде (м/м) в сентябре упал на 0,2% Индекс цен на новое жилье (м/м) в Канаде в сентябре снизился на 0,2%, не дотянув до ожидаемого рынком повышения на 0,1%. В августе индекс цен на новое жилье (м/м) в Канаде вырос на 0,1%. Что такое индекс цен на новое жилье в Канаде (м/м)? Индекс цен...

23:00, 01 Июн Apple раскрыла кое-что новое об iOS 16 прямо перед WWDC 2023 Фото: MacRumors Компания Apple опубликовала данные, которые демонстрируют отношение пользователей к iOS 16. Информацию заметили в MacRumors. Согласно источнику, за несколько дней до WWDC 2023 и анонса iOS 17 Apple предоставила данные о том, как мног...

00:00, 22 Окт Технологии в основе умных городов Концепция "умного города" — это не просто модный термин, а результат долгосрочной работы многих специалистов, научных исследований и внедрения передовых технологий. Создание умного города основывается на совокупности технологий, которые помогают опт...

09:00, 12 Фев Техника распознавания лиц на основе камеры Системы распознавания лиц, вычислительные инструменты, которые могут распознавать людей на изображениях или видеоматериалах, в настоящее время широко используются во всем мире. Однако некоторые пользователи и разработчики выразили обеспокоенность по...

05:00, 11 Сен ТОП 10+ стратегий на основе сигналов Японских Свечей Сегодня публикуем очередную подборку ТОП стратегий этого сайта на основе сигналов японских свечей. Это наиболее стабильные и лучшие, на мой взгляд, торговые системы, на которые стоит обратить внимание. В эту категорию относятся и стратегии по Price ...

01:00, 10 Апр Разрабатывают искусственного патологоанатома Группа ученых из Института наук о свете Макса Планка (MPL) в Эрлангене разработала новый, быстрый и точный метод анализа клеток в образцах тканей раковых больных без участия квалифицированного патологоанатома. Они используют искусственный интеллект ...

09:00, 20 Янв Google представил новые способы поиска на основе ИИ Компания Google запустила два новых инструмента поиска с использованием искусственного интеллекта – Circle to Search и мультипоиск. Об этом говорится в блоге компании. Отмечается, что нововведение сделает поиск более естественным и интуитивно понятн...

18:00, 08 Сен Создана искусственная кожа на основе жидких кристаллов Новый материал может выделять и поглощать жидкость по мере надобности. Фото: YouTube, кадр из трейлера «Двухсотлетний человек» Исследователи из Технического университета Эйндховена (Нидерланды) создали материал, который может впитывать и выпускать в...

22:00, 02 Мар Разработан инструмент на основе ИИ для обнаружения DDoS-атак Новый инструмент на основе ИИ для обнаружения DDoS-атак. Киберпреступники придумывают все более изощренные способы нарушить работу онлайн-сервисов, получить доступ к конфиденциальным данным или вывести из строя устройства пользователей Интернета. Ки...

14:00, 02 Дек Онлайн-игры улучшают карьерные перспективы и развивают межличностные навыки: новое исследование Согласно новому исследованию Университета Суррея, поведение в онлайн-играх может побудить геймеров приобрести различные социальные навыки, которые могут помочь им в обучении для поддержки их карьерных устремлений. Раньше было очень мало известно о п...

01:00, 09 Апр В России начали испытывать лекарство от рака на основе вакцины от оспы Доклинические испытания препарат прошел успешно, сообщают вирусологи. В России специалисты из Института химической биологии и фундаментальной медицины использовали новый подход при разработке препарата для терапии онкологических заболеваний. Ученые ...

04:00, 12 Фев Представлена система регулировки освещения в помещении на основе глубокого обучения Интеллектуальная система регулировки освещения в помещении на основе глубокого обучения. Новая интеллектуальная система регулирования интенсивности внутреннего освещения, основанная на глубоком обучении, описана в International Journal of Industrial...

22:00, 10 Май 256 чипов RISC-V в одном мегакластере. Энтузиаст создал необычное решение на основе контроллеров CH32V003 Автор канала bitluni создал 256-ядерный кластер из чипов на архитектуре RISC-V. Известный своими DIY-устройства блогер Bitluni построил свой собственный мегакластер (так он назвал его сам) RISC-V из 256 чипов спустя год после того, как создал суперк...

18:00, 21 Июл Представлен самый мощный в мире суперкомпьютер для обучения ИИ — Condor Galaxy 1. В его основе всего 64 микросхемы, но каждая размером с iPad Pro Пока в списке самых производительных суперкомпьютеров уже год с огромным отрывом лидирует единственная система с производительностью свыше 1 эксафлопса, а СМИ в основном обсуждают две строящиеся сейчас системы с производительностью свыше 2 эксафлопс...

08:00, 10 Сен Гауфф выграла US Open, Изидор в «Зените», ничьи Англии и Италии, новое поражение Германии, прошел матч памяти Цымбаларя, Каширина лишена трех побед на ЧМ и другие новости 1. 19-летняя Коко Гауфф обыграла Арину Соболенко в финале US Open. Американка выиграла первый «Большой шлем» и дебютирует в топ-3. На турнире она заработала 3 млн долларов. 2. «Локомотив» отдал Вильзона Изидора «Зениту» в аренду с обязательным выкуп...